翻訳後修飾のプロテオミクス
ホンヤクゴシュウショクノプロテオミクス
内容紹介
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目次
- 1 序論
- 1．1 アミノ酸残基の修飾の検出
- 1．2 前駆体ポリペプチドのプロセシング部位の推定
- 1．3 翻訳後修飾の機能解析
- 1．4 翻訳後修飾部位の予測と翻訳後修飾データベース
- 2 質量分析装置
- 2．1 イオン化
- 2．2 質量分析計
- 2．3 選択的反応モニタリング
- 2．4 データベース検索による翻訳後修飾の同定
- 3 翻訳後修飾解析のための試料調製
- 3．1 試料調製における注意点
- 3．2 組織
- 3．3 組織薄切片
- 3．4 培養細胞
- 3．5 血漿・血清
- 4 翻訳後修飾タンパク質の網羅的解析
- 4．1 リン酸化
- 4．2 グリコシル化
- 4．3 N末端修飾
- 4．4 C末端アミド化
- 4．5 酸化
- 4．6 ユビキチン化とSUMO化
- 4．7 脂質修飾
- 4．8 ADPリボシル化
- 4．9 硫酸化
- 4．10 メチル化
- 4．11 アセチル化
- 4．12 ラセミ化
- 4．13 脱イミノ化（シトルリン化）
- 4．14 プロセシング
- 5 デファレンシャルディスプレイ解析
- 5．1 標識法
- 5．2 非標識法
- 5．3 バイオマーカー研究への応用
- 6 翻訳後修飾の機能
- 6．1 翻訳後修飾の機能解析に際しての注意点
- 6．2 翻訳後修飾の同定に基づく機能解析の戦略
- 6．3 修飾部位特異抗体を利用した翻訳後修飾の場とタイミングの解析
- 6．4 翻訳後修飾の人為操作による翻訳後修飾の機能解析
- 6．5 部位特異的変異の導入
- 6．6 修飾酵素や脱修飾酵素の操作による翻訳後修飾の機能解析
- 6．7 RNAiを用いた細胞レベルでの機能解析
- 6．8 遺伝子操作マウスを用いた個体レベルでの機能解析
- 6．9 アナログ感受性キナーゼ変異体を用いた基質タンパク質の同定と因果関係の証明
- 7 翻訳後修飾のインフォマティクス
- 7．1 予測法の原理
- 7．2 予測ソフトウェア
- 7．3 翻訳後修飾データベース
